直播回顾 | Python+AI应用实例:加速临床编程与文本处理工作

2025-04-03

有临医药

240 #有临直播

当全球临床试验深陷“数据爆炸”与“监管高压”的双重夹击,3月27日晚,一场直击临床研究数据管理痛点的直播悄然刷屏。有临医药直播间化身“技术急诊室”,特邀诺华数据库开发专员陈心蕊Flora、有临医药统计分析总监章飞燕“在线问诊”,以《Python+AI应用实例:加速临床编程与文本处理工作》为主题,为行业开出一剂“数字化处方”——用Python的敏捷与生成式AI的智能,重构CRF录入到分析提交效率,助力数据洪流与合规高压下的技术突围。

 

 

 

一、硬核拆解:Python+AI如何“改造”临床数据流水线

 

 

1. 生成式AI:医疗实战的“超能实习生”

让AI听懂“业务黑话”,是破局关键。Flora以生成式AI(Generative AI)为核心,解析其三大能力:自然语言理解代码生成文档摘要。她指出,基于大语言模型(如ChatGPT、Copilot)的AI工具,能够将业务需求快速转化为可执行代码。例如,通过输入“帮我写一个读取CRF数据并导出Excel的程序”,AI可直接生成Python脚本,大幅减少重复性编码工作。

 

2.Python vs SAS:特点对比与联合实践

Flora从临床数据全流程切入,对比Python与SAS在不同环节的适用性:

 

 

 

最佳实践建议

  • 联合使用:前期数据探索与自动化清洗用Python,正式分析与提交用SAS
  • 团队协作:数据管理团队使用Python清洗数据,统计程序员深耕SAS分析
  • 技术融合:通过Python生成SAS宏代码,或调用SAS引擎实现跨平台协作

 

 

3.真实场景案例直击

两位嘉宾通过多个实例,生动展示技术落地场景:

 

  • 案例1: 代码替换

针对项目中规律性代码(如Edit Checks逻辑),通过AI对话功能自动生成新代码片段,替换旧代码,效率提升超50%;

 

  • 案例2:宏功能开发

借助AI审阅所提供代码,能够快速提供代码的结构分析并添加逻辑注释,帮助首次使用者熟悉和理解代码,从而更好地使用和维护代码。

 

  • 案例3:AE/LB数据集分析

根据明确的审阅逻辑,借助AI生成Python代码,比如:Python脚本自动检测不良事件(AE)数据中的逻辑矛盾,如“结局未恢复但记录结束日期”。利用开源的丰富代码库,快速实现数据分析,助力数据审阅。

 

  • 案例4:前后端结合模拟数据

结合CDISC元数据,利用Python的多个库(random, numpy等)与Medidata生成符合CDISC的模拟数据集,支持前后端联合调试,缩短项目启动周期。

 

  • 案例5: 测试数据生成

AI结合Python,针对逻辑核查场景准备多种测试数据,助力开发人员提前验证逻辑核查的代码逻辑。

 

 

二、互动问答深度解析

 

 

1.实例1中提到的图表是自己制作还是AI生成?

答:图表本身并非由AI生成,而是基于临床试验方案中已有的访视表对应关系(如访视周期、表单逻辑)。例如,肿瘤项目中访视表设计时已明确“Month 1”对应“Month 2”,这些结构化关系可直接提供给AI用于正则表达式替换。AI的作用是解析逻辑并生成代码,而非直接绘制图表。

 

2.实例5中前期自建文件能否多项目复用?

答:若文件内容标准化(如统一字段命名、逻辑核查规则),可部分复用。例如:

通用字段:如AESTDAT(不良事件开始日期)和AEENDAT(结束日期)遵循CDISC标准,可直接复用;

项目特有逻辑:需根据新项目需求调整非通用部分(如特定访视规则)。

建议:建立公司内部“智能库”,将通用逻辑核查规则和测试数据模板归档,供多项目调用。

 

3.DeepSeek是否有类似功能?

答:目前国内部分工具(如DeepSeek模型)支持类似功能,但需注意:

功能差异DeepSeek等国产模型在中文理解上有优势,但医疗领域专用训练数据较少;

部署灵活性:可通过API调用实现基础功能,但复杂场景需定制开发;

合规性:建议优先选择支持本地化部署的模型,确保数据闭环。

 

4.AI生成测试数据的逻辑是自主生成还是人工输入?

答:人工定义核心逻辑,AI辅助填充细节。

规则明确型:如“结局标记为‘未恢复’但存在结束日期”,可直接输入逻辑要求,AI生成测试用例;

复杂场景:需人工拆分步骤(如跨表单数据关联),AI按规则生成数据并标注矛盾点;

 

调试关键:生成后需人工验证逻辑完备性,避免AI误读业务规则。

 

5.使用AI工具如何保证数据安全?

本地化部署:敏感数据仅限内部服务器处理,避免上传至公有云;

双重校验AI输出需经“人工审核+规则引擎”双重验证,确保无敏感信息泄露;

数据脱敏:提供给AI的字段仅限标准化命名(如Subject ID),不涉及患者隐私数据。

 

6.是否尝试用AI直接处理DVP和EDC原始数据?

答:目前尚未在开放模型中实践,原因如下:

数据敏感性DVP(数据验证计划)和EDC(电子数据采集系统)数据涉及核心业务逻辑,需严格封闭;

潜在方案:若公司部署本地化大模型(如微软Azure私有云),可尝试上传脱敏数据,由AI辅助生成质疑清单,但需配套权限管理和审计流程。

 

7. 生成OL测试数据推荐哪些本地化部署模型?

答:

DeepSeek R1: 项目开源,拥有接近母语的中文理解能力,相同功能,计算资源占用少;

Azure:微软可协助在国内部署公司私有云,流程完善,缺点是价格较高;

其他国内开源模型

 

8. 是否尝试将所有SOP输入AI实现智能查询?

答:

一、现状:诺华尚未全面实施,但微软已推出企业级方案(如Teams内嵌AI助手),可将SOP文档整合为知识库,员工通过自然语言提问获取指引;

二、挑战:

数据安全:需确保SOP存储于内部服务器,禁止外部访问;

知识更新:SOP修订后需同步更新AI训练数据;

建议:分阶段推进,先从非核心流程(如文件归档规则)试点,再逐步扩展。

 

 

三、未来展望:让数据“跑”赢时间

 

 

全球临床开发的竞争,同样也是数据效能的角力。作为有临医药数统服务的核心力量,有临来雅专注两件事——以技术提速,用合规护航。凭借国内外丰富的临床试验项目经验,不仅支撑中美双报与全球多中心项目的复杂需求,更以灵活创新的合作模式为客户创造价值。依托TrialMaster一体化临床数据平台,实现国际品牌与本土部署的无缝衔接。同时作为CDISC企业会员,我们深植全球数据标准脉络,更好助力客户临床开发国际化和全球电子数据递交。

 

数据从来不只是交付物,我们坚信,数据管理的终极目标是让每一份数据都成为加速新药上市的引擎。

 

 

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小临贴心提示

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